DETEKSI KOMUNITAS PADA JARINGAN BIPARTIT OBAT-TARGET UNTUK PENYAKIT DIABETES MELITUS TIPE II MENGGUNAKAN ALGORITMA BIPARTITE MULTI-LABEL PROPAGATION

FEBRIAN CHRISNA ARDIANTO, . (2026) DETEKSI KOMUNITAS PADA JARINGAN BIPARTIT OBAT-TARGET UNTUK PENYAKIT DIABETES MELITUS TIPE II MENGGUNAKAN ALGORITMA BIPARTITE MULTI-LABEL PROPAGATION. Skripsi thesis, UNIVERSITAS PEMBANGUNAN NASIONAL VETERAN YOGYAKARTA.

	Text 1_Cover_123220051.pdf Download (146kB)
	Text 2_Abstrak_123220051.pdf Download (253kB)
	Text 3_Halaman Pengesahan_123220051.pdf Download (903kB)
	Text 4_Daftar Isi_123220051.pdf Download (208kB)
	Text 5_Daftar Pustaka_123220051.pdf Download (226kB)
	Text 6_Skripsi Full_123220051.pdf Restricted to Repository staff only Download (7MB)

Abstract

Diabetes Melitus Tipe 2 merupakan salah satu penyakit metabolik dengan prevalensi tinggi dan mekanisme biologis yang kompleks, terutama terkait gangguan regulasi glukosa, resistensi insulin, dan perubahan jalur molekuler yang memengaruhi fungsi sel. Dalam pengembangan terapi, interaksi antara obat dan protein target memegang peran penting karena menentukan mekanisme kerja obat serta respons biologis yang terjadi di dalam tubuh. Analisis jaringan obat–target menjadi pendekatan yang relevan untuk memahami pola keterhubungan tersebut, termasuk dalam mengidentifikasi kelompok obat atau protein yang memiliki fungsi atau jalur kerja yang berhubungan. Salah satu teknik yang digunakan untuk menganalisis struktur jaringan adalah deteksi komunitas. Namun, sebagian besar penelitian serupa masih berfokus pada jaringan unipartit, sehingga diperlukan pendekatan yang secara khusus mampu menangani struktur bipartit. Berdasarkan kebutuhan tersebut, penelitian ini bertujuan menerapkan Bipartite Multi-Label Propagation Algorithm (BiMLPA) untuk mendeteksi komunitas pada jaringan bipartit obat–target terkait Diabetes Melitus Tipe 2.
Penelitian ini diawali dengan pengumpulan data obat dari Drugs.com dan data protein target dari PubChem, menghasilkan 33 obat dengan total 2.719 pasangan obat–protein. Setelah melalui proses data preprocessing, sebanyak 1.764 pasangan data digunakan untuk membangun jaringan bipartit yang terdiri dari node obat dan protein target. Algoritma BiMLPA kemudian diterapkan melalui beberapa tahap, mulai dari representasi graf bipartit, inisialisasi label, propagasi label menggunakan fase Multi–Multi dan fase Multi–Single, hingga proses konvergensi. Pengembangan sistem dibangun dengan memanfaatkan antarmuka berbasis Python untuk membantu visualisasi hasil deteksi komunitas dan perhitungan modularity Suzuki. Selain itu, dilakukan enrichment analysis menggunakan Metascape untuk mengidentifikasi fungsi biologis dan jalur molekuler yang berkaitan dengan komunitas yang terbentuk.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa BiMLPA berhasil mempartisi jaringan menjadi 23 komunitas dengan waktu eksekusi 0.2009 detik dan nilai modularity Suzuki sebesar 0.3574, yang menandakan struktur komunitas dengan hubungan internal yang cukup baik. Hasil enrichment analysis menunjukkan bahwa komunitas-komunitas yang terbentuk memiliki makna biologis yang relevan dengan mekanisme T2DM. Komunitas besar berkaitan dengan mekanisme utama T2DM yang bekerja secara luas, seperti pengaturan metabolisme lipid, respons terhadap rangsangan hormon, serta jalur pensinyalan insulin seperti FoxO dan PI3K–Akt. Komunitas sedang mencerminkan mekanisme yang lebih spesifik, termasuk regulasi metabolisme melalui sistem saraf pusat serta proses transportasi molekul dan ekskresi metabolit, seperti regulasi lipid melalui jalur empedu. Sementara itu, komunitas kecil merepresentasikan mekanisme kerja obat yang sangat spesifik, seperti pengendalian metabolisme karbohidrat di saluran pencernaan oleh Acarbose. Temuan ini menunjukkan bahwa BiMLPA tidak hanya efektif dalam mendeteksi struktur komunitas pada jaringan bipartit obat–protein, tetapi juga mampu memberikan interpretasi biologis yang selaras dengan patogenesis dan mekanisme terapi Diabetes Melitus Tipe 2.
Kata Kunci: Diabetes Melitus Tipe 2, Jaringan Obat–Target, Deteksi Komunitas, BiMLPA, Modularity Suzuki.

Item Type:	Tugas Akhir (Skripsi)
Additional Information:	FEBRIAN CHRISNA ARDIANTO (Penulis - 123220051) : HERU CAHYA RUSTAMAJI (Pembimbing) :
Uncontrolled Keywords:	Diabetes Melitus Tipe 2, Jaringan Obat–Target, Deteksi Komunitas, BiMLPA, Modularity Suzuki.
Subjek:	T Technology > T Technology (General)
Divisions:	Fakultas Teknik Industri > (S1) Informatika
Depositing User:	Bayu Pambudi
Date Deposited:	19 Jan 2026 01:18
Last Modified:	19 Jan 2026 01:18
URI:	http://eprints.upnyk.ac.id/id/eprint/46548

Actions (login required)

View Item