Farel, Seva Giantama (2025) PENERAPAN GENETIC ALGORITHM UNTUK DETEKSI KOMUNITAS PROTEIN TARGET PADA PENYAKIT DIABETES MELITUS TIPE 2. Skripsi thesis, UPN "VETERAN" YOGYAKARTA.
|
Text
2_Cover_123210061_Seva Giantama Farel.pdf Download (212kB) |
|
|
Text
3_Abstrak_123210061_Seva Giantama Farel.pdf Download (225kB) |
|
|
Text
4_Halaman Pengesahan Pembimbing_123210061_Seva Giantama Farel.pdf Download (82kB) |
|
|
Text
5_Daftar Isi_123210061_Seva Giantama Farel.pdf Download (290kB) |
|
|
Text
6_Daftar Pustaka_123210061_Seva Giantama Farel.pdf Download (254kB) |
|
|
Text
1_Naskah Tugas Akhir_123210061_Seva Giantama Farel.pdf Restricted to Repository staff only Download (4MB) |
Abstract
Penyakit diabetes melitus tipe 2 merupakan gangguan metabolik kronis dengan
prevalensi global yang terus meningkat. Pemahaman terhadap mekanisme molekuler
penyakit ini melalui analisis jaringan interaksi protein sangat penting untuk mengidentifikasi
potensi protein untuk target terapi. Penelitian ini mengusulkan penerapan genetic algorithm
untuk mendeteksi komunitas protein yang relevan secara fungsional dalam jaringan interaksi
protein yang berkaitan dengan diabetes melitus tipe 2.
Sebanyak 543 gen terkait penyakit diabetes melitus tipe 2 diperoleh dari database
OMIM. Setelah dilakukan prapemrosesan menggunakan STRINGdb, diperoleh jaringan
tidak berarah dan tidak berbobot yang terdiri dari 132 protein dan 350 interaksi. Genetic
algorithm diimplementasikan dengan ukuran populasi 450 selama 1000 generasi,
menggunakan modularity sebagai fungsi fitness untuk mengoptimalkan partisi komunitas.
Analisis fungsional dilakukan menggunakan Metascape guna menilai signifikansi biologis
dari komunitas yang terbentuk.
Genetic algorithm berhasil meningkatkan nilai modularity secara signifikan, dari 0,0009
menjadi 0,5293, dan mengidentifikasi 20 komunitas protein yang berbeda. Hasil analisis
enrichment menunjukkan bahwa beberapa komunitas berasosiasi dengan jalur biologis
utama terkait diabetes melitus tipe 2, seperti jalur pensinyalan insulin, resistensi insulin dan
homeostasis glukosa.
Penelitian ini menunjukkan bahwa genetic algorithm efektif dalam mengungkap struktur
modular yang bermakna secara biologis dalam jaringan interaksi protein spesifik penyakit,
serta memberikan wawasan terhadap mekanisme molekuler dan potensi target terapi pada
diabetes melitus tipe 2.
Kata Kunci: Genetic Algorithm, Diabetes Melitus Tipe 2, Deteksi Komunitas, Jaringan
Interaksi Protein, modularitas
| Item Type: | Tugas Akhir (Skripsi) |
|---|---|
| Additional Information: | Seva Giantama Farel (PENULIS) - 123210061 ; Heru Cahya Rustamaji (PEMBIMBING) |
| Uncontrolled Keywords: | Genetic Algorithm, Diabetes Melitus Tipe 2, Deteksi Komunitas, Jaringan Interaksi Protein, modularitas |
| Subjek: | Q Science > QA Mathematics > QA75 Electronic computers. Computer science |
| Divisions: | Fakultas Teknik Industri > (S1) Informatika |
| Depositing User: | A.Md Eko Suprapti |
| Date Deposited: | 17 Oct 2025 06:53 |
| Last Modified: | 17 Oct 2025 06:53 |
| URI: | http://eprints.upnyk.ac.id/id/eprint/44540 |
Actions (login required)
![]() |
View Item |
